菌-酶协同发酵技术采用固态发酵工艺生产时，需要设施设备具备为益生菌提供生长繁殖的稳定条件，以保证发酵的效果，并提高产品的质量和生产效率。根据物料的周转形式将固态发酵分为静态模式发酵和动态模式发酵两种。动态式发酵是通过固定的容器进行发酵，益生菌发酵时所需热量、氧气等可以迅速有效传递，在一定程度上能够实现自动化、产品品质稳定等，但设备一般造价较高、难于维护。
一、动态发酵模式的优势。动态发酵模式是将物料放在机械动力的容器中进行固态发酵的一种工艺，能够实现物料间断或连续的运动状态，由电气控制物料的传热、传质及周转、自动化程度相对较高、成品品质较好。但这种机械结构相对复杂、设备的消毒比较困难。
二、动态发酵模式的类型。目前常见的动态发酵模式设备有皮带式和车阵式两种。（1）皮带式发酵设备是将物料放置于透气的尼龙材质皮带上料层高度为300-400mm，由链轮机构拖动皮带缓慢运动，将物料直接由混合接种端送到后续工段，物料在输送的同时完成发酵过程、可节省场地空间。设备具有运行稳定可靠、动力结构简单、发酵环境稳定、规模扩展方便、投资不高等优点。但由于皮带式发酵是连续生产所以应变能力差，一旦设备出现故障会使整个生产线停止。（2）车阵式发酵设备是将物料置于若干规格相同的杉木等透气材料的容器中，容积一般为1-2.5m3。能通过电气控制实现物料的翻料、分配和输送，每个容器上都安装了监测设备，并由厂房内部的设备实现发酵环境的调控。车阵式发酵设备具有灵活性好、应变能力高、发酵环境稳定、产量高等优点；但依然存在制作维护成本高、控制复杂、容器消毒困难等问题。
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